Umfassendes Werkzeug zur Verwaltung von Gen-Sets
GeneSetCart ist eine kostenlose Chrome-Erweiterung, die für Forscher und Bioinformatiker entwickelt wurde, um Gen-Sets aus verschiedenen Quellen zu verwalten und zu analysieren. Es integriert nahtlos Gen-Sets von Rummagene und RummaGEO, sodass Benutzer ihre Datensätze mit Gen-Gen-Co-Expression oder Protein-Protein-Interaktionen anreichern können. Diese interaktive webbasierte Anwendung unterstützt den Upload von einzelnen oder mehreren Gen-Sets und ermöglicht es den Benutzern, Mengenoperationen wie Vereinigung, Konsens und Schnittmenge durchzuführen.
Das Tool bietet auch robuste Visualisierungsoptionen, einschließlich Venn-Diagrammen, Heatmaps, UMAP, SuperVenn-Diagrammen und UpSet-Diagrammen, die helfen, die Ähnlichkeiten und Überschneidungen zwischen Gen-Sets zu veranschaulichen. Darüber hinaus erleichtert GeneSetCart die funktionale Anreicherungsanalyse durch Links zu externen Tools wie Enrichr und KEA3 und ermöglicht es den Benutzern, ihre Gen-Sets für zukünftige Analysen oder das Teilen zu speichern, was es zu einer unschätzbaren Ressource für die Hypothesenbildung und Wissensintegration macht.
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